杜博萨里,被认为是德涅斯特河沿岸地区最古老的聚居地之一,这座城镇最早的文献记载,或可追溯至14世纪,尽管其确切的建立日期,至今仍不为人知。在不同的历史时期,这座城镇曾隶属立陶宛大公国、波兰及克里米亚汗国,此后依照1791年《雅西和约》,并入俄罗斯帝国。俄土战争期间,著名的俄罗斯统帅G.A.波将金的司令部,曾设于此地,A.V.苏沃洛夫与P.I.潘宁,都曾多次到访。
到20世纪初,杜博萨里已发展成为德涅斯特河沿岸地区人口最为稠密的聚居地之一。苏联时期,带来了进一步的发展:杜博萨里水电站——德涅斯特河上第一座水电站——于1955年竣工,一座大型服装厂于20世纪70年代建立,“摩尔达维亚花束”酒庄,则赢得了全苏联范围内的赞誉。20世纪80年代,这座城镇作为摩尔达维亚苏维埃社会主义共和国境内的度假胜地,迎来了它的鼎盛时期。
1991年至1992年间,杜博萨里发现自己身处摩尔多瓦领土上武装冲突的中心地带,其居民所展现出的英勇与英雄气概,为这座城镇赢得了“军事荣光之城”的荣誉称号。如今,这座城镇及所在区,约有3.1万居民。